beyinde raphe çekirdeğinde sentezlenir. serotonin yetersizliğinde; anksiyete ile birlikte seyreden depresyon, panik, fobiler, posttravmatik stres bozukluğu, obsesyonlar, kompülsiyonlar, yeme bozuklukları meydana gelebilir.
toprakla haşır neşir olunması neticesinde de beyin tarafından salgılanır.
ek: toprakta yaşayan (b: mycobacterium vaccae) adlı bir bakterinin, beyinde serotonin üretimini artırdığı kanıtlanmıştır.